История кафедры начинается с 1955 года, когда в Высшем авиационном училище Гражданского воздушного флота (ВАУ ГВФ, позднее Высшее авиационное училище гражданской авиации – ВАУ ГА) в числе первых восьми кафедр была организована кафедра эксплуатации воздушных линий и самолетно-моторного парка. ВАУ ГВФ (ВАУ ГА) первоначальное название Академии гражданской авиации, переименованной в 2006 году в Санкт-Петербургский государственный университет гражданской авиации (СПб ГУГА).
В начале 1956 года на базе кафедры эксплуатации воздушных линий и самолетно-моторного парка была создана кафедра эксплуатации воздушного транспорта, которая входила в состав командного факультета. В начале 1963 года на должность начальника кафедры эксплуатации воздушного транспорта Совет училища избрал О.А. Овчинникова, ранее работавшего начальником планового отдела Северо-Кавказского территориального управления ГВФ. С 1964 года эта кафедра стала называться кафедрой экономики гражданской авиации.
Кафедра организации производства включалась в состав командного факультета. За ней закреплялись дисциплины: организация и планирование работ воздушного транспорта, научная организация труда и управления, организация планирования авиационного производства, математические методы планирования и управления, организация воздушных перевозок, материально-технического снабжения, охрана труда, основы гражданского и трудового права, воздушное право. При кафедре создавались кабинеты перевозок пассажиров, авиации спецприменения, охраны труда.
Исполняющим обязанности начальника кафедры был назначен доцент О.А. Овчинников. В становление кафедры большой вклад внесли доценты С.Н. Подкаминер, А.С. Гуртовых, ст.преподаватели. М.А. Фиников, М.М., Волков В.Д., Саморуков, Г.А. Букин, В.Г. Новиченков.
Кафедру экономики с 1966 по 1969 год возглавляла доктор экономических наук, профессор И.В. Сиповская, имевшая большой опыт подготовки инженеров-экономистов. Существенным образом были переработаны курсы кафедры: экономика воздушного транспорта, основы экономической географии и географии ВТ, единая транспортная сеть и взаимодействие различных видов транспорта, статистика, бухгалтерский учет, финансы ВТ. Эти курсы читали проф. И.В. Сиповская, доценты Г.И. Исаков, И.Е. Борисов, ст. преподаватели Т.А. Огнева, И.И. Блатт, П.Н. Котов.
При кафедре действовала научно-исследовательская лаборатория экономики, организации и планирования гражданской авиации, а также кабинет экономики гражданской авиации.
Кафедру экономики ГА в 1969 году после перехода в другой вуз профессора И.В. Сиповской, вновь возглавил доцент О.А. Овчинников, человек редких душевных качеств, внесший большой вклад в становление и развитие кафедры, способствовавших сохранению ее целостности в трудный период. Умелый организатор и творец науки, он возглавил разработку и внедрение типовых проектов механизации учетно-плановых работ в ГА, проявил себя одним из лучших лекторов. В его лекциях сочетались глубина теоретического содержания, практическая направленность и проблемность обучения. В 1970 году было издано написанное им вместе с А.Д. Кожевниковым учебное пособие «Планирование деятельности эксплуатационного предприятия», а в последующем и ряд других пособий по дисциплинам кафедры.
Большой заслугой О.А. Овчинникова явилось то, что на кафедре
сложился творческий коллектив энтузиастов научной и учебной работы. В истории ВАУ – Академии ГА хорошо известны имена И.Е. Борисова, П.Н. Мешкова, А.П. Шубина, Г.И. Исакова, Т.А. Огневой, Г.Н. Чижовой и других научно-педагогических работников кафедры, вкладывавших свою творческую энергию в разработку теоретических и практических вопросов экономики гражданской авиации и подготовку высококвалифицированных специалистов для отрасли. Они проявили себя отличными лекторами. Им была присуща широкая эрудиция, умение поддерживать обратную связь с аудиторией, четкость изложения материала лекций, проведения практических занятий.
Возглавляя на протяжении ряда лет научные исследования, направленные на разработку предложений по совершенствованию планирования и хозрасчета эксплуатационного предприятия ГА, проектов механизации расчетов по международным авиаперевозкам, учетно-плановых работ, зарплаты, материальных ценностей, кассовых и банковских операций и т.д., И.Е. Борисов, А.П. Шубин, Г.И. Исаков, П.Н. Мешков добились хороших результатов. Внедренные проекты на предприятиях Северного, Северо- Кавказского, Восточно-Сибирского, Казахского, Уральского, Грузинского территориальных управлений дали общий экономический эффект более 1 млн. руб. На основе материалов научных исследований эти ученые опубликовали в 1968-1971 годах учебно-методические пособия «Хозяйственный расчет в ГА, «Анализ производственно-хозяйственной деятельности», «Научные основы управления производством», «Организация и планирование работы воздушного транспорта». Они существенно облегчили изучение слушателями, студентами и курсантами
соответствуюших дисциплин кафедры.
Этот период характеризовался ростом научных кадров, что проявлялось в защите диссертаций, тесной связи с производством: кафедра
пополнилась опытными экономистами. Кандидатские диссертации защитили Г.И. Исаков, А.П. Шубин, П.Н. Мешков.
В разные годы кафедра входила в состав командного факультета, Факультета подготовки высшего управленческого персонала. С апреля 2000 года кафедра Экономики ГА была переименована в кафедру № 17 Экономики и включена в состав Факультета авиационного менеджмента. С декабря 2007 г. в связи с реструктуризацией Университета гражданской авиации, кафедра экономики была закреплена за Институтом экономики и управления транспортными системами.